Jono Čerskio vardo įamžinimas

Jo vardu pavadintos vietovės

1899 Čerskio kalnagūbris Užbaikalėje (Čitos sritis)
1927 Čerskio kalnagūbris Jakutijoje
1937 Čerskio slėnis. Juo teka Kandato upė tarp Rytų Sajanų ir Jenisejaus kalnagūbrių
1953 Čerskio viršūnė Baikalo ežero šiaurės vakarų krante
1953  Čerskio stovyklavietė – pirmykščių žmonių stovyklavietė Irkutsko apylinkėse

Čerskio viršūnė Chamar Dabano kalnagūbryje, Baikalo ežero pietrytiniame krante
Čerskio ola ant Baikalo ežero kranto prie Angaros upės ištakos iš ežero
Čerskio ugnikalnis Tunkos slėnyje, Buriatijos Autonominėje Respublikoje
Čerskio pakrantė prie Irtyšiaus, netoli Omsko, kur jis tyrė terciaro periodo nuogulas
Čerskis Jakutijos miestas, Nižnekolymsko rajono centras, buvusi Nižnije Krestai gyvenvietė
J. Čerskio gatvė Kairėnuose, Vilnius

Fosilijos (suakmenėjusios gyvūnų iškasenos)
Leperditia Czerskii Toli (Vėžiagyvis) iš E. Tolio rinkinio, atvežto iš Kotelno salos. Aprašė E. Tolis
Osteolepis Tscherskii Rohon (Žuvis) iš Minusinsko krašte J. Čerskio surinkto rinkinio. Aprašė J. Rogonas
Polyptichites Tscherskii Pav (Amonitas) iš E. Tolio Anabaro kolekcijos. Aprašė A. Pavlovas
Synanthedon Czerskii stiklasparnis drugys
Čerskio arklys anksčiau mokslui nežinomos rūšies atstovas, rastas Jakutijoje, Indigirkos aukštupyje netoli Selerikano

Jono Čerskio gyvenimas ir moksliniai tyrimai domino daugelį geologijos ir geografijos mokslo istorijos tyrėjų. Apie tai parašytas ne vienas straipsnis, išleista knygų lietuvių, lenkų, vokiečių, anglų, rusų ir baltarusių kalbomis. Jose, remiantis archyviniais dokumentais, atkuriamas ankstyvasis Jono Čerskio gyvenimo kelias, jo tremtis į Sibirą, mokslinių tyrimų ir atradimų sunkumai tremtyje, pripažinimas ir ankstyva mirtis.